Вход в систему 
Информация о диссертации
- Кандидатская диссертация
- Лопастейская Яна Анатольевна
- «Системы автоматизированного микробиологического анализа в лабораторной диагностике патогенных буркхольдерий»
- 03.02.03 - Микробиология
- медицинские науки
- 21.2.005.06
- Волгоградский государственный медицинский университет
- 400131, Волгоград, пл.Павших Борцов, 1 ВолгГМУ
- Предполагаемая дата защиты диссертации: 5 сентября 2017 года
- [Полный текст диссертации (1.3 Мбайт)] (Опубликован: 9 февраля 2017 года)
- [Автореферат диссертации (774 кбайт)]
- Дата публикации объявления 12 июня 2017 года
Отзывы на диссертацию *
- Научный руководитель
- Д.В. Викторов, заместитель директора по научной и экспериментальной работе ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора, д.б.н., доцент
- Скачать отзыв (2.8 Мбайт)
- Опубликован: 9 февраля 2017 года
- Официальный оппонент
- Загоскина Т.Ю., заведующая отделом подготовки и усовершенствования специалистов ФКУЗ Иркутский ордена Трудового Красного Знамени НИИ противочумный институт Сибири и Дальнего Востока Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, д.м.н.
- Скачать отзыв (4.8 Мбайт)
- Опубликован: 22 августа 2017 года
- Официальный оппонент
- Заднова С.П., д.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории патогенных вибрионов ФКУЗ Российский научно-исследовательский противочумный институт Микроб Роспотребнадзора
- Скачать отзыв (6.6 Мбайт)
- Опубликован: 22 августа 2017 года
- Ведущая организация
- Богун А.Г.,к.б.н., зав.отделом коллекционных культур ФБУН ГНЦ ПМБ
- Скачать отзыв (269 кбайт)
- Опубликован: 22 августа 2017 года
- Отзыв на автореферат
- Тихонов С.Н. к.м.н., доцент, директор ФГКУЗ ПЧС Республики Крым Роспотребнадзора
- Скачать отзыв (999 кбайт)
- Опубликован: 22 августа 2017 года
- Отзыв на автореферат
- Осина Н.А., заведующая лабораторией молекулярной диагностики ФКУЗ Российский научно-исследовательский противочумный институт Микроб, к.б.н.
- Скачать отзыв (494 кбайт)
- Опубликован: 22 августа 2017 года
- Отзыв на автореферат
- Лопатин А.А., к.м.н., заместитель директора ФКУЗ Противочумный центр Роспотребнадзора
- Скачать отзыв (1.8 Мбайт)
- Опубликован: 30 августа 2017 года
Решения диссертационного совета
ВЫПИСКА из протокола № 2 заседания Диссертационного совета Д 208.008.06 ФГБОУ ВО «Волгоградский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения РФ от 9 июня 2017 года
Присутствовало: 18 членов Диссертационного Совета из 23, утвержденных ВАК РФ в составе Совета.
Слушали: заключение членов комиссии доктора медицинских наук профессора Замарева В.С., доктора медицинских наук, профессора Яковлева А.Т., доктора медицинских наук, профессора Сливиной Л.П., по рассмотрению диссертации Лопастейской Яны Анатольевны на тему: «Системы автоматизированного микробиологического анализа в лабораторной диагностике патогенных буркхольдерий», представленной на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 – Микробиология (заключение прилагается).
Постановили:
1.Принять к защите диссертацию Лопастейской Яны Анатольевны на тему «Системы автоматизированного микробиологического анализа в лабораторной диагностике патогенных буркхольдерий», представленную на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 – Микробиология.
2. Утвердить в качестве официальных оппонентов:
- доктора биологических наук, ведущего научного сотрудника лаборатории патогенных вибрионов ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора, профессора Заднову Светлану Петровну, г.Саратов.
- доктора медицинских наук, заведующую отделом подготовки и усовершенствования специалистов ФКУЗ «Иркутский ордена трудового красного знамени научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора Загоскину Татьяну Юрьевну, г.Иркутск.
3.Утвердить в качестве ведущей организации ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Серпуховский р-н, пос. Оболенск
4.Разрешить печатание и рассылку автореферата диссертационной работы.
5.Утвердить дату защиты 5 сентября 2017 года.
Председатель диссертационного совета, д.м.н., профессор Клаучек С.В.
Ученый секретарь диссертационного совета, д.с.н., профессор Ковалёва М.Д
Протокол № 1 заседания диссертационного совета Д 208.008.06 от 05.09.2017
Состав диссертационного совета утвержден в количестве 23 человек. Присутствовали на заседании 18 человек.
Председатель: д. Клаучек Сергей Всеволодович
Присутствовали: д. Гавриков Леонид Константинович, д. Губанова Екатерина Ивановна, д. Клаучек Валентина Васильевна, д. Замараев Валерий Семенович, д. Давыденко Людмила Александровна, д. Ковалева Марина Дмитриевна, д. Липницкий Анатолий Васильевич, д. Крамарь Олег Григорьевич, д. Латышевская Наталья Ивановна, д. Филатов Борис Николаевич, д. Попов Александр Сергеевич, д. мед.наук, профессор Сливина Людмила Петровна, д. биол.наук, профессор Солопов Игорь Николаевич, д. Храпова Наталья Петровна, д. Яковлев Анатолий Трофимович, д. Клаучек Сергей Всеволодович, д.Краюшкин Сергей Иванович
Официальные оппоненты по диссертации: д. б.н. Заднова С.П., Загоскина Т.Ю.
Ведущая организация: Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора.
Слушали: Председателя диссертационного совета Д 208.008.06 Клаучека С.В., председателя счетной комиссии Попова А.С.
Постановили: диссертация Лопастейской Я.А. является законченной научно-квалификационной работой, что соответствует критериям, установленным п.9 «Положения о порядке присуждения ученых степеней...». Присудить Лопастейской Я.А. ученую степень кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 Микробиология.
Результаты голосования: «за» - 18, «против» - 0, «недействительных» - 0.
Председатель совета Клаучек Сергей Всеволодович
Ученый секретарь совета Ковалева Марина Дмитриевна
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ДИССЕРТАЦИОННОГО СОВЕТА Д 208.008.06 на базе Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Волгоградский государственный медицинский университет» Минздрава России по диссертации на соискание учёной степени кандидата наук
аттестационное дело № ________
решение диссертационного совета от 05.09.2017 года, протокол № 1 О присуждении Лопастейской Яны Анатольевны, гражданке Российской Федерации, ученой степени кандидата медицинских наук.
Диссертация «Системы автоматизированного микробиологического анализа в лабораторной диагностике патогенных буркхольдерий» по специальности 03.02.03 – Микробиология, принята к защите 09.06.2017 года, протокол № 1 диссертационным советом Д 208.008.06 на базе Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования (ФГБОУ ВО) «Волгоградский государственный медицинский университет» Минздрава России, 400131, г. Волгоград, пл. Павших борцов, 1, (Приказ № 1925-1358 от 9 сентября 2009 г., с изменениями состава совета от 22.10.2010 года, № 2472-984/591, действующий на период действия номенклатуры специальностей научных работников).
Соискатель Лопастейская Яна Анатольевна, 1982 года рождения. В 2006 г. окончила Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Волгоградский государственный медицинский университет» Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию по специальности «Лечебное дело».
Работает научным сотрудником лаборатории геномики и протеомики Федерального казённого учреждения здравоохранения (ФКУЗ) «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора с ноября 2008 года и по настоящее время.
Диссертация выполнена в ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора.
Научный руководитель: д.б.н., доцент Викторов Дмитрий Викторович, заместитель директора по научной и экспериментальной работе ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора.
Официальные оппоненты: 1. Заднова Светлана Петровна д.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории патогенных вибрионов ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора;
- Загоскина Татьяна Юрьевна д.м.н., заведующая отделом подготовки и усовершенствования специалистов ФКУЗ «Иркутский ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора,
- дали положительные отзывы на диссертацию.
Ведущая организация: Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, г. Оболенск, в своём положительном заключении, подписанном д.м.н., профессором Анисимовым Андреем Павловичем, заведующим отделом коллекционных культур, к.б.н. Богуном Александром Геннадьевичем, указала, что диссертация Лопастейской Я.А. является законченной научно-квалификационной работой, в которой на современном уровне решена актуальная научная задача разработки усовершенствованного алгоритма идентификации и внутривидового типирования возбудителей мелиоидоза и сапа с применением современных систем микробиологического анализа, что имеет существенное значение для микробиологии и соответствует требованиям п. 9 «Положение о порядке присуждения ученых степеней…..»
Соискатель имеет 25 опубликованных научных работ, в том числе по теме диссертации - 9 работ, опубликованных в рецензируемых научных изданиях, рекомендованных ВАК РФ - 4.
Наиболее значительные научные работы:
- Лопастейская Я.А. Применение времяпролетной масс-спектрометрии с матрично активированной лазерной десорбцией-ионизацией (maldi-tof) для идентификации возбудителей сапа и мелиоидоза / Я.А. Лопастейская, Т.Н. Шаров, Е.В. Молчанова, Ю.А. Кузютина, Д.В. Викторов, А.В. Топорков // Клиническая лабораторная диагностика. - 2016. - Т. 61, № 8. - С. 501-508. (журнал перечня ВАК РФ);
- Молчанова Е.В. Особенности идентификации Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei с помощью микробиологического анализатора Vitek 2 compact 30 / Е.В. Молчанова, Я.А. Лопастейская, А.В. Незнамова, Ю.А. Кузютина, Н.П. Агеева, И.Б. Захарова, Д.В. Викторов, А.В. Топорков // Проблемы особо опасных инфекций. - 2016. - № 3. - С. 57-61. (журнал перечня ВАК РФ);
- Незнамова А.В. Особенности идентификации микроорганизмов комплекса Burkholderia cepacia и рода Pseudomonas с помощью биохимического автоматического анализатора VITEK 2 / Я.А. Лопастейская, Е.В. Молчанова, Н.П. Агеева, Д.В. Викторов // Вестник Волгоградского государственного медицинского университета. - 2016. - Т. 59, № 3. - С. 109-112. (журнал перечня ВАК РФ).
Работы посвящены особенностям пробоподготовки и идентификации патогенных буркхольдерий с помощью систем автоматизированного микробиологического анализа.
На диссертацию и автореферат поступили отзывы от: зам. директора ФКУЗ «Противочумный центр» Роспотребнадзора, к.м.н. Лопатина А.А.; зав. лабораторией молекулярной диагностики ФКУЗ Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб», к.б.н. Осиной Н.А.; директора ФГКУЗ «Противочумная станция Республики Крым», к.м.н, доцента Тихонова С.Н.
Все отзывы положительные, подтверждают актуальность представленной работы, обоснованность полученных выводов, практическую и научно-теоретическую значимость результатов исследования. Критических замечаний в отзывах не содержится.
Выбор официальных оппонентов и ведущей организации обосновывается тем, что д.б.н., Заднова С.П. и д.м.н. Загоскина Т.Ю. являются компетентными учеными, экспертами в области микробиологии особо опасных бактериальных инфекций, что подтверждается, в том числе, публикациями в научных рецензируемых журналах. Выбор ведущей организации обосновывается тем, что Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, г. Оболенск является одним из ведущих научно-методических центров страны по вопросам микробиологии патогенных микроорганизмов, способным определить научную и практическую ценность данной работы. Сотрудниками центра за последние 5 лет был опубликован ряд работ в научно-рецензируемых журналах, связанных с предметной областью диссертации соискателя.
Заключение
Диссертационный совет отмечает, что на основании выполненных соискателем исследований:
разработана новая научная идея, заключающаяся в возможности минимизации риска некорректной видовой идентификации возбудителей мелиоидоза и сапа при использовании современных автоматизированных систем микробиологического анализа в схеме лабораторной диагностики;
предложены методические приемы и аналитические алгоритмы, обеспечивающие точное ускоренное определение видовой принадлежности изолятов патогенных буркхольдерий, что важно для своевременного проведения противоэпидемических и профилактических мероприятий;
Теоретическая значимость исследования обоснована тем, что:
доказаны положения о ключевых биохимических признаках для корректной видовой идентификации штаммов возбудителей мелиоидоза и сапа, оптимальной схеме пробоподготовки и эффективности сформированной базы масс-спектров для идентификации исследуемых микроорганизмов;
применительно к проблематике диссертации результативно использован комплексный подход к оценке внутривидовой вариабельности патогенов, включающий анализ спектров биохимической активности и MALDI-TOF масс-спектрометрическое профилирование консервативных клеточных протеинов;
изложены характеристики эффективности применения биохимических идентификационных тестов для установления видовой принадлежности штаммов возбудителей мелиоидоза и сапа, а также пробоподготовки бактериальных культур и получения набора референтных масс-спектров;
раскрыты особенности корректной идентификации возбудителя мелиоидоза с учетом характера вариабельности ряда диагностических биохимических признаков;
изучены закономерности и характер изменчивости диагностических фенотипических признаков у штаммов различного происхождения, что позволяет определить оптимальный алгоритм идентификации культур возбудителей мелиоидоза и сапа.
Значение полученных соискателем результатов исследования для практики подтверждается тем, что:
определены перспективы практического использования положений диссертации в исследовательской, диагностической и образовательной деятельности, осуществляемой Волгоградским НИПЧИ. Полученные новые сведения о фенотипических признаках, имеющих принципиальное значение для корректного определения видовой принадлежности культур B. pseudomallei и B. mallei, оптимальных режимах пробоподготовки для масс-спектрометрического анализа, референтных масс-спектрах патогенных видов буркхольдерий конкретизируют схему идентификации и дифференциации штаммов возбудителей мелиоидоза и сапа с применением современных систем автоматизированного микробиологического анализа;
разработан и внедрен в практику работы Референс-центра по мониторингу за возбудителями мелиоидоза и сапа на базе Волгоградского НИПЧИ комплекс технологических приемов использования систем микробиологического анализа для идентификации и внутривидового типирования штаммов B. pseudomallei и B. mallei;
создана система практических рекомендаций по идентификации и внутривидому типированию штаммов возбудителей мелиоидоза и сапа с использованием систем микробиологического анализа, использованная при разработке зарегистрированной базы данных масс-спектров микроорганизмов I-II групп патогенности, проектов нормативно-методических документов федерального уровня и внедренных учрежденческих инструктивно-методических документов.
Оценка достоверности результатов исследования выявила, что полученные автором основные экспериментальные результаты получены на сертифицированном аналитическом оборудовании;
теория построена на проверяемых фактах и согласуется с современными представлениями и опубликованными данными исследований по теме диссертации;
идея исследования базируется на анализе отечественного и зарубежного практического опыта, показавшем недостаточность проработанности вопроса о применимости распространенных биохимических идентификационных систем, а также эффективности использования масс-спектрометрического анализа для определения видовой принадлежности изолятов патогенных буркхольдерий;
использованы зарегистрированные диагностические наборы;
доказана воспроизводимость результатов исследования, выявленные закономерности подтверждены с использованием методов статистического анализа;
установлено качественное совпадение авторских результатов с результатами, представленными в независимых источниках по данной тематике.
Личный вклад соискателя состоит в том, что исследование выполнено автором самостоятельно на всех этапах его проведения. Соискатель принимал непосредственное участие в получении исходных данных, их обработке, интерпретации и апробации, а также в подготовке основных публикаций по выполненной работе. Диссертация охватывает основные вопросы поставленной научной задачи и соответствует критерию внутреннего единства, что подтверждается наличием последовательного плана исследования, непротиворечивой методологической базы, основной идейной линии и взаимосвязи выводов.
Диссертационный совет пришёл к выводу о том, что диссертация представляет собой научно-квалификационную работу, в которой содержится решение актуальной научной задачи - разработка усовершенствованного алгоритма идентификации и внутривидового типирования возбудителей мелиоидоза и сапа с применением современных систем микробиологического анализа, что имеет существенное значение для микробиологии.
На заседании 5 сентября 2017 года диссертационный совет принял решение присудить Лопастейской Яне Анатольевне ученую степень кандидата медицинских наук.
При проведении тайного голосования диссертационный совет в количестве 18 человек, из них 5 докторов наук по специальности 03.02.03 – Микробиология, участвовавших в заседании, из 23 человек, входящих в состав совета, проголосовали: за присуждение учёной степени - 18, против присуждения учёной степени - нет, недействительных бюллетеней - нет.
Председатель диссертационного совета Клаучек Сергей Всеволодович
Ученый секретарь диссертационного совета Ковалева Марина Дмитриевна
5 сентября 2017 года.